科技合作处是承担院地合作工作的职能部门。主要职责是：
　　1、负责指导、协调分院系统的科技合作与院地合作工作；
　　2、负责中科院与上海市、浙江省、福建省等院地合作工作的协调、联络与服务及相关的工作；
　　3、负责中科院与上海、浙江、福建共建的研究机构、研发机构的联系、协调与服务及相关的工作；
　　4、负责分院系统研究所参加院和地方政府主办的科技成果展览、洽谈会的组织、协调工作，承办中国国际工业博览会；
　　5、负责分院系统科研工作信息、技术项目信息的收集、统计和分析工作，建立信息资料库，承办科技合作网；
　　6、负责参与上海“一网两库”及分院系统科研仪器设备需要分院协调、服务的相关工作；
　　7、承担为分院系统科技企业服务及相关工作；
　　8、组织协调分院系统的科学家发挥思想库的作用。负责中科院在沪院士和分院系统工程院院士的联络、服务等工作。承办东方论坛；
　　9、负责科技副职派遣、考核及相关工作；
　　10、领导交办的其它工作。

处长：田申荣 电话:64310242-5266,64334166
主要职责：领导全处工作。负责院地合作规划，系统院地合作工作的组织与协调，多学科交叉交流等工作。

副处长：章文峻 电话:64310242-5216,64332908

主要职责：协助处长工作。分管研究所发展动态分析工作；负责系统科研成果、技术转移成果统计分析、科技副职等工作。